More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3897 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  97.08 
 
 		 171 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  91.38 
 
 		 175 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  56.32 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.98 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.34 
 
 		 208 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.91 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.53 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.3 
 
 		 202 aa  180  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  49.71 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.35 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.94 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.7 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.7 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.7 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  50.59 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.13 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.26 
 
 		 205 aa  174  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  48.57 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 196 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  48.07 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  48.07 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  48.07 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  48.07 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.07 
 
 		 196 aa  168  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  45.66 
 
 		 199 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  47.98 
 
 		 222 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  47.51 
 
 		 196 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  47.51 
 
 		 196 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  47.06 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  42.44 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  45.56 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  44.71 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  39.31 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  39.39 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  40.37 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  43.48 
 
 		 191 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  38.51 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  37.27 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  47.37 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  43.83 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  40.57 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  39.88 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  43.75 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  42.76 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  42.76 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  42.76 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.78 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.23 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.1 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  41.89 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  41.89 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  38.69 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  42.77 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  39.23 
 
 		 183 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  41.22 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  42.33 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  44.16 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  36.2 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  44.29 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  41.88 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  43.79 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  38.89 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  33.14 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  37.89 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  39.62 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  36.84 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  37.58 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.04 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  32.75 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  34.97 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  39.26 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  37.93 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  34.34 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  40.72 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  39.08 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.93 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2729  transferase  43.6 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  36.05 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3399  transferase hexapeptide protein  42.76 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  37.93 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  38.01 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  36.59 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  46.38 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9131  transferase hexapeptide protein  44.22 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5483  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily protein  45.26 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3096  transferase hexapeptide protein  42.24 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  36.47 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  42.67 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  38.15 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  38.6 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>