More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0917 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 175 aa  348  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.34 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  43.86 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  42.69 
 
 		 203 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.34 
 
 		 208 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  46.75 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  40.83 
 
 		 196 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  40.88 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  41.18 
 
 		 195 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  40.24 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  40.24 
 
 		 196 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.64 
 
 		 198 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  40.24 
 
 		 196 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.64 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.1 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  39.31 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  42.6 
 
 		 199 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  40.88 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  40.24 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  42.01 
 
 		 199 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  42.01 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  38.92 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  42.01 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  40.88 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  41.88 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  38.67 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  38.67 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  38.67 
 
 		 196 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.67 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  38.67 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  38.67 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  38.67 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  38.95 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  38.95 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  38.95 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  38.95 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  38.69 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  38.37 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  39.51 
 
 		 199 aa  120  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40.51 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  46.21 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.82 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  39.33 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  36.9 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  35.9 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  36.24 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  33.73 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  34.97 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  35.9 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.19 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  35.9 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.08 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  37.18 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  37.18 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  39.74 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  36 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  35.9 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  35 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.256343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1347  ferripyochelin binding protein  34.84 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  34.81 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  35.9 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  33.13 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.58 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  35.88 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  31.95 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2729  transferase  46.21 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  36.13 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  35.57 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  42.25 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  36.08 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  38.41 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  35.22 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  34.18 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.62 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  34.18 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  34.36 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  38.12 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  36.31 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  35.26 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  33.97 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>