More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2268 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  335  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  58.96 
 
 		 172 aa  206  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  57.56 
 
 		 174 aa  194  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  57.65 
 
 		 188 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  48.78 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  45.91 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  43.27 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  43.1 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  45.09 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  42.26 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  42.26 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  45.34 
 
 		 177 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.31 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.31 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.31 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  42.53 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  45.83 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  40.61 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  42.2 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  38.73 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  42.26 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  39.43 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  40.24 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  40.23 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  37.57 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  41.28 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.12 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  41.28 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  40.38 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  37.79 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  37.79 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  39.63 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  41.45 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  38.29 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.16 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  40.52 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  41.62 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  37.79 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  37.79 
 
 		 196 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  37.79 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  37.79 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  37.13 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  35.76 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2053  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 		 173 aa  121  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  37.79 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  40.46 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.76 
 
 		 203 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  37.21 
 
 		 198 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  38.24 
 
 		 199 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  40.25 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  38.19 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.18 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  37.21 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  37.21 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.31 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  37.21 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.42 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  37.21 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  39.43 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3096  transferase hexapeptide protein  45.73 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  39.87 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  36.57 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  36.99 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  36.99 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  36.99 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  36.99 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  39.22 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  40.45 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  38.82 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  36.42 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.97 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  38.51 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  41.86 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  40.61 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  43.67 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  38.79 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  38.55 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  34.68 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  32.53 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  39.74 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  36.21 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0832  hexapaptide repeat-containing transferase  34.68 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  40.96 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.42 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  37.43 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  38.18 
 
 		 199 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  40.41 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  33.73 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  38.67 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  38.65 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  41.21 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  38.18 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>