More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4032 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  80.1 
 
 		 196 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  72.22 
 
 		 198 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  72.22 
 
 		 198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  72.22 
 
 		 198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  72.22 
 
 		 198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  71.72 
 
 		 198 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  69.74 
 
 		 196 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  69.74 
 
 		 196 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  69.74 
 
 		 196 aa  288  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  69.74 
 
 		 196 aa  288  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  69.23 
 
 		 196 aa  287  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  69.23 
 
 		 196 aa  286  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  68.72 
 
 		 196 aa  286  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  69.23 
 
 		 196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.49 
 
 		 196 aa  247  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.9 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.97 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.97 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.97 
 
 		 196 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.79 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.78 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  60.11 
 
 		 205 aa  234  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.78 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.51 
 
 		 200 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.7 
 
 		 203 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.84 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  56.15 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.81 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.08 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  51.53 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  47.69 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  46.45 
 
 		 196 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  47.98 
 
 		 176 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  40.86 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  47.95 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  46.24 
 
 		 175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  40.66 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  48.12 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  38.73 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.93 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  37.57 
 
 		 174 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  38.69 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  41.61 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  39.52 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  36.48 
 
 		 173 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  36.91 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  39.02 
 
 		 166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  38.95 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  36.54 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  38.04 
 
 		 175 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  37.43 
 
 		 180 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  35.8 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  37.74 
 
 		 174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.66 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  37.06 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  37.93 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  37.93 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  38.32 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  36.55 
 
 		 172 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  34.9 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.22 
 
 		 166 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  35.68 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.54 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  33.74 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  34.55 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  35.76 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  36.48 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.79 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1343  ferripyochelin binding protein (fbp)  34.69 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000136354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.57 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.15 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  36.24 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  36.59 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  34.09 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  34.5 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.65 
 
 		 175 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  36.65 
 
 		 175 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  35.57 
 
 		 174 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  29.84 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  33.78 
 
 		 162 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  34.94 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.42 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  35.57 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  35.57 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  34.9 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  33.11 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  36.55 
 
 		 170 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  36.42 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2729  transferase  39.16 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  32.22 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  32.22 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.11 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  36.55 
 
 		 170 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  40.6 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  34.19 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  35.09 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  36.55 
 
 		 170 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  35.17 
 
 		 170 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>