More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1164 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
171 aa  338  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  62.5 
 
 
177 aa  187  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  48.78 
 
 
174 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  48.78 
 
 
174 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  48.17 
 
 
174 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  47.56 
 
 
174 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  45.78 
 
 
173 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  47.56 
 
 
174 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  47.56 
 
 
174 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  47.56 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  49.4 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  47.56 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  46.01 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  54.82 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  52.5 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  53.46 
 
 
170 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  46.43 
 
 
174 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  53.46 
 
 
170 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  53.46 
 
 
170 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  50 
 
 
191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  45.4 
 
 
174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  53.8 
 
 
173 aa  160  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  46.2 
 
 
174 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  44.79 
 
 
174 aa  160  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  46.67 
 
 
174 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.79 
 
 
174 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  42.51 
 
 
173 aa  158  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  47.27 
 
 
174 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  46.67 
 
 
174 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  52.23 
 
 
183 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  46.84 
 
 
172 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  47.56 
 
 
173 aa  156  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  48.47 
 
 
174 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  47.02 
 
 
174 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  44.87 
 
 
170 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  45.24 
 
 
174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  47.27 
 
 
174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  51.57 
 
 
194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  48.72 
 
 
174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
174 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  45.78 
 
 
172 aa  154  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  48.47 
 
 
174 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.88 
 
 
174 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  47.85 
 
 
177 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  46.67 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  49.04 
 
 
174 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  43.03 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  46.15 
 
 
174 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.88 
 
 
181 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  45.73 
 
 
177 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  46.11 
 
 
177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  46.5 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  38.92 
 
 
175 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  46.06 
 
 
174 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
173 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  49.06 
 
 
173 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  44.58 
 
 
172 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.24 
 
 
177 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  44.58 
 
 
172 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  51.68 
 
 
196 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  49.33 
 
 
163 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  45.28 
 
 
174 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9131  transferase hexapeptide protein  49.69 
 
 
185 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  45.86 
 
 
174 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  47.65 
 
 
176 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  39.76 
 
 
173 aa  147  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  45.4 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  44.31 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  41.03 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  42.11 
 
 
176 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  44.17 
 
 
175 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  47.74 
 
 
173 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  50.93 
 
 
182 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.95 
 
 
175 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  45.33 
 
 
172 aa  144  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  48.45 
 
 
172 aa  144  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  43.95 
 
 
175 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  43.03 
 
 
175 aa  144  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  42.33 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  42.33 
 
 
174 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  44.52 
 
 
261 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  44.59 
 
 
174 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  48.15 
 
 
176 aa  143  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  42.04 
 
 
173 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  49.06 
 
 
187 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.16 
 
 
163 aa  143  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  41.21 
 
 
174 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.76 
 
 
166 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  44.59 
 
 
174 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  47.77 
 
 
174 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  46.67 
 
 
174 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.1 
 
 
175 aa  141  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>