More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2406 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  74.37 
 
 		 200 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  72.86 
 
 		 200 aa  288  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  67.84 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  67.86 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  70.97 
 
 		 199 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  68.23 
 
 		 199 aa  267  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  69.35 
 
 		 199 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.83 
 
 		 202 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  67.2 
 
 		 199 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  62.37 
 
 		 196 aa  254  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  62.37 
 
 		 196 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  62.37 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  62.37 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  61.83 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  61.29 
 
 		 196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  64.21 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.9 
 
 		 196 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  61.83 
 
 		 196 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  61.83 
 
 		 196 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 		 196 aa  248  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 		 196 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  60.1 
 
 		 198 aa  247  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.83 
 
 		 196 aa  247  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  60.1 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  60.1 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  60.1 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  59.57 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  59.59 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  60.75 
 
 		 196 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  54.84 
 
 		 222 aa  225  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  52.17 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  51.91 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  49.45 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  54.34 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  52.87 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  54.71 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  45.95 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  47.34 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.92 
 
 		 172 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  39.66 
 
 		 175 aa  128  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  44.52 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  41.04 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  42.24 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  45.45 
 
 		 172 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  42.94 
 
 		 188 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  40.46 
 
 		 174 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  41.72 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.65 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  38.41 
 
 		 154 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  40.25 
 
 		 174 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  38.51 
 
 		 162 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  39.52 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  39.52 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.71 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  39.6 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  42.51 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  36.67 
 
 		 157 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  43.42 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  41.36 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  43.42 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  43.42 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  38.85 
 
 		 168 aa  115  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  41.61 
 
 		 163 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  44.23 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  41.25 
 
 		 175 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  39.77 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  39.2 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  38.41 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  38.46 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  43.21 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.11 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  38.12 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  40.35 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.71 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  41.18 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  37.2 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  39.16 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  35.84 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 		 174 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  37.13 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.71 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  38.46 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  38.99 
 
 		 175 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 		 174 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  39.53 
 
 		 174 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.88 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  39.62 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  38.36 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  37.65 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.05 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  42.75 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  37.27 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  38.55 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>