More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2998 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.48 
 
 
203 aa  275  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.37 
 
 
205 aa  269  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.83 
 
 
208 aa  265  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.82 
 
 
200 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.94 
 
 
199 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.44 
 
 
199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.93 
 
 
199 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.6 
 
 
199 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  63.1 
 
 
200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.42 
 
 
198 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.14 
 
 
196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  55.61 
 
 
195 aa  224  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  57.53 
 
 
196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.6 
 
 
196 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.6 
 
 
196 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.6 
 
 
196 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  55.08 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  53.06 
 
 
198 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  53.06 
 
 
198 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  53.06 
 
 
198 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  53.06 
 
 
198 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  53.06 
 
 
198 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  51.55 
 
 
196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  51.55 
 
 
196 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  51.55 
 
 
196 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  51.55 
 
 
196 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  51.55 
 
 
196 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  51.03 
 
 
196 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  51.03 
 
 
196 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  51.55 
 
 
196 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  48.91 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  47.59 
 
 
199 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  45.65 
 
 
204 aa  184  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  45.5 
 
 
196 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  52.3 
 
 
176 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  52.05 
 
 
175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  52.05 
 
 
171 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  44.64 
 
 
175 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  46.88 
 
 
173 aa  134  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.44 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  42.42 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  46.06 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  42.2 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  44.31 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  44.31 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.03 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  38.12 
 
 
175 aa  124  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  41.89 
 
 
175 aa  124  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  46.06 
 
 
172 aa  124  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  41.67 
 
 
172 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  43.88 
 
 
173 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  41.92 
 
 
172 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  37.89 
 
 
170 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  46.31 
 
 
191 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  41.03 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  45.32 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  42.55 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  40.35 
 
 
174 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  44.74 
 
 
170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  44.74 
 
 
170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  40.24 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  44.74 
 
 
170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  43.71 
 
 
183 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  41.94 
 
 
171 aa  118  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  40.54 
 
 
185 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  39.01 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  44.81 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  39.01 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1599  acetyltransferase/acyltransferase  35.59 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  39.72 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  39.72 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  39.72 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  39.72 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  40.82 
 
 
174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  43.54 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  40.72 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  38.3 
 
 
170 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  38.3 
 
 
170 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  38.3 
 
 
170 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  38.3 
 
 
170 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  38.89 
 
 
168 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  43.57 
 
 
234 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  41.61 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3399  transferase hexapeptide protein  41.57 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  40 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  44.52 
 
 
182 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  38.89 
 
 
175 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  47.83 
 
 
196 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  43.54 
 
 
174 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  41.22 
 
 
172 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  41.88 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  37.34 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  41.46 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  42.42 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  40.49 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  37.36 
 
 
176 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  34.3 
 
 
174 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>