More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3084 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  73.98 
 
 		 196 aa  308  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  73.98 
 
 		 196 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  73.47 
 
 		 196 aa  304  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  73.47 
 
 		 196 aa  304  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.22 
 
 		 203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.05 
 
 		 199 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.44 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.09 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.44 
 
 		 200 aa  251  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  64.21 
 
 		 208 aa  251  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.9 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  63.44 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  59.69 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 		 199 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  59.9 
 
 		 222 aa  246  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  59.18 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  59.18 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  59.18 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  59.18 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  59.18 
 
 		 198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  57.95 
 
 		 196 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  58.46 
 
 		 196 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  58.46 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  58.46 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  58.46 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  58.46 
 
 		 196 aa  235  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  57.95 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  57.95 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  56.38 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.42 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  51.02 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  53.4 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  47.54 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  45.95 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  49.71 
 
 		 176 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  50.29 
 
 		 171 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  47.98 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  43.83 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  39.64 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  38.73 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  40.76 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  43.54 
 
 		 173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  40.85 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  40.85 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  39.23 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  40 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.37 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  40.94 
 
 		 185 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  39.04 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  42.26 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  38.36 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  38.36 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  37.67 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  38.36 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  41.07 
 
 		 177 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  39.66 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  40.14 
 
 		 163 aa  121  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  39.66 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  40.23 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.58 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  40.25 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  40.82 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  36.31 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  39.38 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  36.57 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.79 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  39.6 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  36.99 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  36.99 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  42.75 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  40.96 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  40.4 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  42.38 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  36.77 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  39.44 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  39.74 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  38.15 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  32.37 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  38.78 
 
 		 154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  37.04 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  36.99 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  35.43 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.4 
 
 		 174 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  38.38 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  41.1 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  35.67 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  38.89 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  38.89 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>