More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1203 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  100 
 
 
175 aa  352  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  49.37 
 
 
173 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  45.28 
 
 
174 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  44.1 
 
 
174 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  44.65 
 
 
174 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  44.87 
 
 
168 aa  151  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  42.24 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  47.13 
 
 
175 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  44.23 
 
 
168 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  46.5 
 
 
171 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  46.15 
 
 
170 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  46.63 
 
 
170 aa  147  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  47.77 
 
 
175 aa  147  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  45.62 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  45.86 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  45.62 
 
 
182 aa  145  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  46.79 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
261 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  42.14 
 
 
172 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  45 
 
 
182 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  45 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  40.25 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  45 
 
 
175 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  42.14 
 
 
172 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  41.14 
 
 
173 aa  143  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  42.58 
 
 
157 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  44.38 
 
 
175 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  42.14 
 
 
172 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  42.77 
 
 
175 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  40.24 
 
 
174 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  44.59 
 
 
160 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  40.24 
 
 
174 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  42.77 
 
 
174 aa  140  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  42.14 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  40.99 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  43.71 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  43.31 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  44.94 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  42.68 
 
 
170 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  42.68 
 
 
170 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.59 
 
 
166 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  42.68 
 
 
170 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.3 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  40.76 
 
 
173 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  39.02 
 
 
174 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  43.67 
 
 
173 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2793  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.29 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000628922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  44.44 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  38.61 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  40.13 
 
 
178 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  43.23 
 
 
172 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1343  ferripyochelin binding protein (fbp)  45.22 
 
 
176 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000136354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  41.89 
 
 
154 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 
173 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  47.1 
 
 
196 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  39.02 
 
 
174 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
192 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  41.4 
 
 
174 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  47.48 
 
 
174 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  44.3 
 
 
182 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  42.04 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  39.02 
 
 
174 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  40.51 
 
 
173 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  39.63 
 
 
174 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  41.4 
 
 
174 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  40.12 
 
 
181 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  39.87 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  39.63 
 
 
172 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  40.76 
 
 
174 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  40.76 
 
 
174 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  38.41 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  43.95 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  41.77 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  39.02 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  40.13 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  41.29 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  43.03 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0832  hexapaptide repeat-containing transferase  40.13 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  41.43 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  42.86 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  45.68 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  45.52 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  37.97 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  38.16 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.72 
 
 
180 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  42.77 
 
 
174 aa  131  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  39.47 
 
 
178 aa  131  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  41.4 
 
 
183 aa  131  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  42.07 
 
 
176 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  37.11 
 
 
174 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  38.93 
 
 
174 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>