More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2224 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  100 
 
 
173 aa  348  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  56.21 
 
 
174 aa  207  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  54.91 
 
 
174 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  53.25 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  54.39 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  53.85 
 
 
174 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.12 
 
 
181 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  53.25 
 
 
174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  53.8 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  53.85 
 
 
174 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  51.46 
 
 
173 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  51.45 
 
 
174 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  51.48 
 
 
174 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  52.3 
 
 
176 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  51.45 
 
 
174 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  49.13 
 
 
176 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 
174 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  50.87 
 
 
174 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  50 
 
 
174 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  52.3 
 
 
178 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
174 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
174 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  49.7 
 
 
174 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  52.66 
 
 
174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  50.29 
 
 
174 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 
174 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  51.46 
 
 
174 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 
174 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.98 
 
 
176 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  50.57 
 
 
176 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  53.8 
 
 
170 aa  187  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  187  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  50 
 
 
172 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
173 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  49.12 
 
 
175 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  51.18 
 
 
180 aa  184  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  49.12 
 
 
175 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
174 aa  183  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  45.98 
 
 
176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  49.43 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  47.34 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  49.12 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  45.4 
 
 
177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
192 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  47.34 
 
 
175 aa  180  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  48.28 
 
 
176 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  48.84 
 
 
172 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  48.52 
 
 
174 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  48.84 
 
 
172 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  49.12 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  50 
 
 
175 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  49.4 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.25 
 
 
177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  50.58 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  46.2 
 
 
174 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  45.93 
 
 
173 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  177  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  46.75 
 
 
174 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  47.02 
 
 
174 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  50.88 
 
 
174 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  46.78 
 
 
175 aa  174  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  45.61 
 
 
175 aa  173  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  46.51 
 
 
172 aa  172  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  46.2 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  46.51 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  45.93 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  45.93 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  45.61 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  43.35 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  47.09 
 
 
174 aa  171  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  46.43 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  50.29 
 
 
206 aa  170  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  49.71 
 
 
177 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  45.09 
 
 
174 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3912  hypothetical protein  47.13 
 
 
176 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  49.69 
 
 
174 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 
173 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1556  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.59 
 
 
173 aa  168  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2053  hexapaptide repeat-containing transferase  45.35 
 
 
173 aa  167  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1720  hexapaptide repeat-containing transferase  46.2 
 
 
174 aa  167  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  42.2 
 
 
177 aa  167  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  41.18 
 
 
176 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  45.4 
 
 
176 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  46.51 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  51.9 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  44.05 
 
 
174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.08 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  41.52 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  44.44 
 
 
232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  48.28 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  48.28 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  48.28 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>