More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0020 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  92 
 
 		 177 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  88 
 
 		 186 aa  325  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  84 
 
 		 177 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  81.71 
 
 		 177 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  80.57 
 
 		 177 aa  301  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  57.71 
 
 		 174 aa  214  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  47.22 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  52.57 
 
 		 175 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  47.22 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  52 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  51.43 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  47.22 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  52.02 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  52.27 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  48.02 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  50 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  50.29 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  50 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  50.57 
 
 		 175 aa  177  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  48.85 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  48.26 
 
 		 171 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  44.89 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  48.28 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  48.88 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  50 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  52.63 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  47.43 
 
 		 256 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  47.43 
 
 		 293 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  47.43 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  47.43 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  47.43 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  53.49 
 
 		 175 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  47.46 
 
 		 182 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  46.86 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  46.55 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  47.13 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  49.13 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  47.43 
 
 		 256 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  46.55 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  47.46 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  46.55 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  46.55 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  46.86 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  46.86 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  47.19 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.28 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  48.26 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  48.02 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  45.98 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  45.51 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  47.13 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  48.31 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  47.75 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  47.13 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  45.51 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  46.29 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  49.12 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  47.13 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  45.51 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  49.71 
 
 		 189 aa  163  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  42.46 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  47.19 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  44.94 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  46.55 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  46.33 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  47.09 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  49.43 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  49.7 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  44.89 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.42 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  48.26 
 
 		 170 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  48.26 
 
 		 170 aa  160  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  49.42 
 
 		 172 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  47.67 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  43.82 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  45.98 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  44.57 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  47.67 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  46.29 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  46.55 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  44.89 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  47.09 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  47.09 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  47.09 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  47.09 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  47.13 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  47.09 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  47.67 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  49.12 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  47.09 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  48 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  42.37 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  46.24 
 
 		 179 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  45.51 
 
 		 181 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>