More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0039 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  99.49 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  99.49 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  98.47 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  97.45 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  97.96 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  98.47 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  97.45 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  85.64 
 
 		 198 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  85.64 
 
 		 198 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  85.64 
 
 		 198 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  85.64 
 
 		 198 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  85.13 
 
 		 198 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  69.23 
 
 		 222 aa  285  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  68.72 
 
 		 196 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 		 208 aa  254  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.67 
 
 		 196 aa  247  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.67 
 
 		 196 aa  247  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.67 
 
 		 196 aa  247  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.49 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.65 
 
 		 196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.28 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.44 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.44 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  57.75 
 
 		 195 aa  238  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.46 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.73 
 
 		 203 aa  237  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.92 
 
 		 199 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  58.29 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.2 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  54.1 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.55 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  50.26 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  46.74 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  43.85 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  49.42 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 		 171 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  50 
 
 		 175 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  38.67 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40 
 
 		 172 aa  124  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.62 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  41.67 
 
 		 173 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  37.79 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.24 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  36.63 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  38.99 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  36.48 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  36.21 
 
 		 174 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  37.65 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  37.06 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  41.45 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.11 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  38.69 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  39.13 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  36.48 
 
 		 174 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.65 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  36.84 
 
 		 163 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  34.1 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  35.85 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  37.27 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  36.65 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  37.27 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  36.65 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  36.65 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  35.39 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  36.65 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.25 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  36.65 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  35.48 
 
 		 170 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  36.97 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  31.61 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  37.87 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  34.02 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  34.18 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  37.28 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  34.93 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  35.42 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  37.87 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  38.62 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.73 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.22 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  38.6 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  36.47 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  35.5 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  36.14 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  35.22 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>