More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1487 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  99.49 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  98.98 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  73.47 
 
 		 198 aa  304  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.98 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.59 
 
 		 203 aa  248  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  58.67 
 
 		 196 aa  247  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  58.16 
 
 		 196 aa  246  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  58.67 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  58.67 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  58.67 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  58.67 
 
 		 196 aa  244  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.58 
 
 		 200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.03 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  60 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  58.16 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  58.97 
 
 		 222 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  58.16 
 
 		 196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  58.16 
 
 		 196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.03 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  56.12 
 
 		 198 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  56.12 
 
 		 198 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  56.12 
 
 		 198 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.46 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  55.61 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  55.61 
 
 		 198 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  58.06 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.6 
 
 		 202 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  54.45 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  55.19 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  53.23 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  48.63 
 
 		 204 aa  197  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  48.91 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  47.7 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  48.82 
 
 		 171 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  45.98 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  40.23 
 
 		 175 aa  141  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  42.77 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  40.24 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  45.28 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  44.12 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  41.5 
 
 		 157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  42.42 
 
 		 173 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.67 
 
 		 172 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  39.31 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  44.68 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  43.9 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  42.2 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  42.04 
 
 		 168 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  41.51 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.04 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  41.84 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.34 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  40.23 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  37.79 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  39.66 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  42.14 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  35.84 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  40.94 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  36.42 
 
 		 174 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  38.73 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  42.14 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  42.14 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.99 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  45.03 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  45.03 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  38.67 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 		 174 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.45 
 
 		 176 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  42.14 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  40.91 
 
 		 261 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  41.13 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  40.14 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  41.46 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  42 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.62 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.63 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  38.33 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40.48 
 
 		 172 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  35.84 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  40.25 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  41.67 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  40.11 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  39.18 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  40.7 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  39.55 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  38.24 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.55 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1720  hexapaptide repeat-containing transferase  38.73 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  43.31 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.26 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>