More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0385 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  81.28 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  67.86 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.48 
 
 		 202 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  66.32 
 
 		 199 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  66.32 
 
 		 199 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.27 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.79 
 
 		 199 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.22 
 
 		 198 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  63.04 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  64.13 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.57 
 
 		 199 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.59 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.59 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.04 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  64.48 
 
 		 196 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  58.76 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  58.76 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  58.76 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  58.25 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  58.25 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  57.73 
 
 		 196 aa  237  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  57.73 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  57.73 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  57.22 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  57.22 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  56.52 
 
 		 195 aa  234  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.22 
 
 		 196 aa  234  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  57.22 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  57.22 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  58.7 
 
 		 222 aa  227  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  50.54 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  49.72 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  45.41 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  53.57 
 
 		 171 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  52.98 
 
 		 176 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  52.98 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  44.86 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  42.69 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  40.12 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  40.61 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  44.03 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  41.89 
 
 		 162 aa  125  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  46.75 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  38 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.04 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  42.77 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  41.56 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.54 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  43.11 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  39.76 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.65 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  38.19 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  41.36 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  37.42 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  37.97 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.71 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  35.29 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  39.46 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  37.2 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  37.42 
 
 		 173 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  38.95 
 
 		 174 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  46.15 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  38.32 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  38.18 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  38.82 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  46.15 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  46.15 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  39.87 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  40.49 
 
 		 172 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  37.84 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  38.69 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  35.23 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  36.63 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  41.06 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  38.55 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  35.93 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  35.4 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  34.71 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  37.2 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  36.53 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  35.47 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  36.69 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  35.5 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  39.88 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3096  transferase hexapeptide protein  42.33 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.67 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  36.36 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  39.61 
 
 		 163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  35.84 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.46 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3399  transferase hexapeptide protein  38.61 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>