More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2611 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  96.98 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  96.48 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  81.91 
 
 		 199 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  68.23 
 
 		 208 aa  267  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.79 
 
 		 203 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.21 
 
 		 205 aa  254  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  58.97 
 
 		 195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.9 
 
 		 198 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.02 
 
 		 200 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  60 
 
 		 198 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  59.49 
 
 		 198 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  59.49 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  59.49 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  59.49 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.97 
 
 		 196 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.44 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  58.97 
 
 		 196 aa  241  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  61.46 
 
 		 200 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.46 
 
 		 196 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.46 
 
 		 196 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.46 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 196 aa  237  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.92 
 
 		 196 aa  234  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  55.9 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  55.78 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  56.41 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  56.41 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  50.82 
 
 		 196 aa  214  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  45.23 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  44.32 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  52.94 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  52.35 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  43.48 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  51.76 
 
 		 175 aa  175  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  42.01 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  41.67 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  41.67 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  41.76 
 
 		 174 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.74 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  38.18 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  40.48 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  39.05 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  39.74 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  40.12 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  41.32 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  41.72 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.03 
 
 		 177 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  43.48 
 
 		 166 aa  118  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  36.84 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  40.85 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.99 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  39.39 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  36.47 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  38.18 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  40.76 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  36.97 
 
 		 174 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.94 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  38.6 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  38.65 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  41.92 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  40.25 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  37.43 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  39.88 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  37.13 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  35.37 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  40.85 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  40.85 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  37.65 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  33.54 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  38.18 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  39.63 
 
 		 172 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  34.59 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  36.2 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.36 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  36.36 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  38.36 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3096  transferase hexapeptide protein  41.88 
 
 		 170 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  34.62 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  38.79 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  36.49 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  35.22 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  37.28 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.82 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  36.08 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  36.47 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  35.85 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>