More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1008 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  100 
 
 
176 aa  346  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  55.49 
 
 
234 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  49.42 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.09 
 
 
175 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  48.86 
 
 
177 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 
174 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 
174 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  45.88 
 
 
174 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 
174 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 
174 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  45.29 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  44.71 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  47.73 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  43.35 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 
174 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  49.1 
 
 
172 aa  160  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  43.93 
 
 
174 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.88 
 
 
174 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  46.59 
 
 
175 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  45.03 
 
 
174 aa  158  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  46.02 
 
 
177 aa  158  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  49.7 
 
 
173 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  41.62 
 
 
174 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 
174 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  38.95 
 
 
173 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  47.17 
 
 
174 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  47.31 
 
 
173 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  41.76 
 
 
174 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  47.8 
 
 
174 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.45 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  47.8 
 
 
174 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  44.03 
 
 
174 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  48.12 
 
 
174 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  43.35 
 
 
174 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  43.35 
 
 
175 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  43.27 
 
 
174 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  46.71 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  42.2 
 
 
176 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  41.52 
 
 
173 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  40.8 
 
 
174 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  45.66 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  45.03 
 
 
172 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  44.07 
 
 
176 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  45.03 
 
 
172 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  43.93 
 
 
174 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  46.11 
 
 
174 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  42.2 
 
 
175 aa  151  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  42.2 
 
 
175 aa  151  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  42.77 
 
 
174 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  45.4 
 
 
174 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  45.51 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  43.2 
 
 
172 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  45.14 
 
 
177 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  46.06 
 
 
187 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  44.23 
 
 
170 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  43.86 
 
 
172 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 
174 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 
174 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 
174 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  45.51 
 
 
174 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  40.94 
 
 
174 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  42.77 
 
 
176 aa  148  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9131  transferase hexapeptide protein  44.71 
 
 
185 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  43.56 
 
 
174 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  41.62 
 
 
173 aa  147  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  47.13 
 
 
170 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  47.13 
 
 
170 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  47.13 
 
 
170 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  44.12 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  43.11 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  42.11 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  45.45 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  40.59 
 
 
174 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  44.51 
 
 
174 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  46.06 
 
 
173 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  44.19 
 
 
176 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1253  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  53.68 
 
 
190 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  41.38 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  54.81 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  41.21 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5226  hypothetical protein  41.14 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  43.29 
 
 
174 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  42.29 
 
 
176 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  39.55 
 
 
176 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.85 
 
 
177 aa  144  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  38.51 
 
 
175 aa  144  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 
176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  41.18 
 
 
178 aa  144  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  41.28 
 
 
174 aa  144  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  41.21 
 
 
170 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  43.37 
 
 
191 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  48.15 
 
 
171 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  42.51 
 
 
174 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  41.95 
 
 
175 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>