More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_73060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  96.24 
 
 
186 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  87.1 
 
 
186 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  84.95 
 
 
186 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  84.95 
 
 
186 aa  315  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  83.87 
 
 
186 aa  310  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  75.81 
 
 
186 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  75.27 
 
 
186 aa  291  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  75.81 
 
 
186 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  75.81 
 
 
186 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  75.81 
 
 
186 aa  291  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  76.34 
 
 
186 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  74.73 
 
 
186 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  73.12 
 
 
186 aa  284  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  68.82 
 
 
186 aa  270  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  68.82 
 
 
186 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  63.28 
 
 
177 aa  227  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  38.1 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  36.63 
 
 
204 aa  129  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  36.23 
 
 
273 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  38.59 
 
 
666 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  38.59 
 
 
666 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  39.66 
 
 
672 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  38.33 
 
 
675 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  35.33 
 
 
552 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  38.98 
 
 
556 aa  111  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  34.01 
 
 
248 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  36.25 
 
 
650 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  34.45 
 
 
205 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  33.87 
 
 
539 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.31 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  36.8 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  32.95 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  30.91 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  33.53 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  32.94 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  32.35 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  34.03 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  33.11 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  32.35 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  31.43 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  32.35 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  31.91 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  30.97 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  30.97 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  32.52 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  37.91 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.11 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  37.6 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  34.35 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  35.56 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  31.79 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  36.92 
 
 
232 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  37.01 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  35.16 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  35.16 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  31.61 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  31.61 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  35.48 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  33.8 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  33.09 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  35.54 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  30.52 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  35.54 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  34.38 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  39.5 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  33.54 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  35.54 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  27.81 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  35.54 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  37.7 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  30.49 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  32.92 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  29.14 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.56 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  36.59 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  34.35 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  33.1 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  33.81 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  30.68 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  28.14 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  31.33 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  32.43 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  30.29 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  35 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  31.14 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  36.21 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  35.34 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  28.14 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  32.33 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  29.01 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  30.49 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  30.64 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>