More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2579 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  96.24 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  89.78 
 
 		 186 aa  342  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  86.02 
 
 		 186 aa  331  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  84.95 
 
 		 186 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  83.33 
 
 		 186 aa  317  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  71.51 
 
 		 186 aa  283  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  72.58 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  70.43 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  70.97 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  70.43 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  70.43 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  69.89 
 
 		 186 aa  264  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  69.89 
 
 		 186 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  67.2 
 
 		 186 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  69.35 
 
 		 186 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  64.97 
 
 		 177 aa  231  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  37.2 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  36.51 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  36.63 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  34.24 
 
 		 675 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  36.41 
 
 		 672 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  34.78 
 
 		 666 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  34.78 
 
 		 666 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  32.61 
 
 		 552 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  34.38 
 
 		 650 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  36.16 
 
 		 556 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  32.65 
 
 		 248 aa  94.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  33.16 
 
 		 205 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  31.72 
 
 		 539 aa  89.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  36.57 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  33.14 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  32.57 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  32 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  39.23 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  42.97 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  32 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  32 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  39.23 
 
 		 163 aa  85.5  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  31.03 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  36.64 
 
 		 175 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  36.81 
 
 		 232 aa  84.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  32.35 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  32.35 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  31.76 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  32 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  32 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  36.92 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  37.12 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  37.3 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  34.38 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  38.17 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.57 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  38.52 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  30.91 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  38.17 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  29.94 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  32.02 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  29.94 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  29.94 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  34.59 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  39.55 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  35.38 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  38.1 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  35.07 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  36.3 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  35.42 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  34.92 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  32.34 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  36.92 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  36.94 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  33.82 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1961  ferripyochelin binding protein  35.29 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  32.48 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.71 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  34.33 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  32.85 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  34.92 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  36.72 
 
 		 163 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  29.95 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  34.31 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  35.21 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.98 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.56 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  34.62 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  34.71 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  31.65 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  36.8 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  30.11 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>