More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2615 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  68.82 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  67.2 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  67.74 
 
 		 186 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  67.2 
 
 		 186 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  67.74 
 
 		 186 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  67.2 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  67.2 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  67.2 
 
 		 186 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  66.13 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  66.13 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  66.13 
 
 		 186 aa  256  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  65.05 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  66.13 
 
 		 186 aa  255  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  67.2 
 
 		 186 aa  255  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  62.37 
 
 		 186 aa  247  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  65.54 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 273 aa  123  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  35.45 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  37.85 
 
 		 556 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 672 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  34.44 
 
 		 675 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  33.89 
 
 		 552 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 666 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 666 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  32.32 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  35.33 
 
 		 650 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  32.81 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  39.55 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  38.12 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  33.71 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  34.29 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  34.29 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  33.71 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  33.71 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  31.55 
 
 		 539 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  36.18 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  35.82 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  34.66 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  36.14 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  32.57 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  32.57 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  38.28 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.64 
 
 		 166 aa  85.1  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  31.21 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  36.09 
 
 		 170 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  37.31 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  36.09 
 
 		 170 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  36.09 
 
 		 170 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  39.02 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  30.43 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  30.43 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  38.52 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  39.02 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  39.02 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  37.4 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.02 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  38.21 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  35.22 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  34.52 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  30.81 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  39.02 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  37.4 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  35.85 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  39.02 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  39.02 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  35.8 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  38.93 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  34.39 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  38.58 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  29.71 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  34.68 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  30.64 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  32.02 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  29.94 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  30.56 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  32.02 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  32.02 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  32 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  32.02 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  35.94 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  33.81 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  41.94 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  35.94 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  32.16 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  31.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  31.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  32.58 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  38.21 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  31.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  37.1 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  31.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  38.21 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  40.15 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  38.21 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  38.21 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3096  transferase hexapeptide protein  33.54 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  37.4 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  29.55 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>