More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06412 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  100 
 
 
177 aa  355  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  65.54 
 
 
186 aa  241  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  64.97 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  64.41 
 
 
186 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  62.71 
 
 
186 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  63.28 
 
 
186 aa  228  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  63.28 
 
 
186 aa  227  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  61.58 
 
 
186 aa  226  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  62.15 
 
 
186 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  62.15 
 
 
186 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  61.02 
 
 
186 aa  223  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  57.63 
 
 
186 aa  218  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  58.19 
 
 
186 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  57.63 
 
 
186 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  57.63 
 
 
186 aa  210  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  57.63 
 
 
186 aa  210  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  57.06 
 
 
186 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  42.05 
 
 
204 aa  145  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  36.99 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  39.27 
 
 
273 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  36.67 
 
 
672 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  34.83 
 
 
556 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  33.89 
 
 
675 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  33.33 
 
 
552 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  34.44 
 
 
666 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  34.44 
 
 
666 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  32.81 
 
 
248 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  31.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40.94 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  37.59 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  34.29 
 
 
650 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.05 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  30.41 
 
 
539 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  34.97 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  40.15 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  38.89 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  33.82 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  36.72 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  36.72 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  35.94 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  32.93 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  32.93 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  36.72 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  38.33 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  36.72 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  40.5 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  37.5 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  37.3 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.88 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  34.38 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  34.17 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  35.11 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.29 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  35.48 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  35.48 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.23 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.15 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  36.36 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  34.62 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  31.98 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  36.57 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  37.82 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  37.21 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.61 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  33.59 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  37.61 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  32.81 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  35.94 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  36.36 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  30 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  34.92 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  37.61 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  37.01 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  35.61 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  37.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  37.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  35.71 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  35.07 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  32.31 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  37.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  37.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  41.32 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  33.61 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  32.81 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  37.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  32.81 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  28.09 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  37.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1347  ferripyochelin binding protein  35.2 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  32.79 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  35.83 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  35.94 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  37.19 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  34.34 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  36.75 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.17 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  33.73 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>