More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3849 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  54.45 
 
 
666 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  54.45 
 
 
666 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  100 
 
 
672 aa  1389    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  50.8 
 
 
675 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  53.76 
 
 
552 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  53.1 
 
 
556 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  47.2 
 
 
650 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  48.99 
 
 
539 aa  525  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  41.33 
 
 
248 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  40 
 
 
183 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  35.23 
 
 
205 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  40.78 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  39.66 
 
 
186 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  38.59 
 
 
186 aa  120  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  37.99 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  35.75 
 
 
186 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  38.55 
 
 
186 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  37.99 
 
 
186 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  37.99 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  37.99 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  37.99 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  36.96 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  36.67 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  36.87 
 
 
186 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2132  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  47.62 
 
 
408 aa  108  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0344956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  36.96 
 
 
186 aa  107  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  36.41 
 
 
186 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  36.41 
 
 
186 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3903  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  46.15 
 
 
414 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  35.87 
 
 
186 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1574  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  41.18 
 
 
423 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  41.48 
 
 
170 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  41.48 
 
 
170 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  41.48 
 
 
170 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
204 aa  90.5  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4299  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  42.86 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  32.16 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  35.06 
 
 
173 aa  84  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  33.89 
 
 
179 aa  84  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  38.52 
 
 
172 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  36.3 
 
 
191 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  33.99 
 
 
174 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  32.03 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  37.04 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  36.11 
 
 
177 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  36.76 
 
 
167 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  34.33 
 
 
171 aa  75.1  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  31.69 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.59 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  37.78 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  36.29 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  34.51 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  33.93 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  32.86 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  36.29 
 
 
196 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  32.86 
 
 
174 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  35.42 
 
 
173 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
176 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  32.86 
 
 
185 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  36.29 
 
 
196 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  32.86 
 
 
174 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  32.54 
 
 
182 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  37.69 
 
 
180 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  36.29 
 
 
196 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  30.56 
 
 
184 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  36.29 
 
 
196 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  38.21 
 
 
154 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  32.26 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  38.81 
 
 
173 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  36.29 
 
 
196 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  36.29 
 
 
196 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.29 
 
 
196 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  36.09 
 
 
170 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  34.27 
 
 
172 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  34.27 
 
 
172 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  34 
 
 
172 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  36.29 
 
 
196 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  37.88 
 
 
184 aa  72.4  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
167 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  31.58 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  30.29 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  32.21 
 
 
172 aa  72  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  38.06 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  36.24 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  31.9 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  32.62 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  32.85 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  34.85 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  34.06 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  32.3 
 
 
175 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  32.35 
 
 
181 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.97 
 
 
169 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
173 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  32.3 
 
 
175 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  32.62 
 
 
174 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  33.58 
 
 
180 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>