17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3903 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3903  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  100 
 
 		 414 aa  855    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2132  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  80.54 
 
 		 408 aa  691    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0344956  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1574  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  62.56 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4299  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  62.41 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31184  predicted protein  56.4 
 
 		 415 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0093852  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37239  predicted protein  43.96 
 
 		 381 aa  236  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00188315  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3956  predicted protein  44.75 
 
 		 342 aa  213  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  35.41 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  50 
 
 		 552 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  61.18 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  51.49 
 
 		 675 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  46.15 
 
 		 672 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  44.55 
 
 		 539 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  26.92 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  24.68 
 
 		 747 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>