21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2132 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2132  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  100 
 
 
408 aa  846    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0344956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3903  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  80.54 
 
 
414 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1574  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  59.86 
 
 
423 aa  528  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4299  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  60.28 
 
 
423 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31184  predicted protein  54.67 
 
 
415 aa  342  5.999999999999999e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0093852  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37239  predicted protein  40.94 
 
 
381 aa  219  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00188315  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3956  predicted protein  43.19 
 
 
342 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  58.76 
 
 
666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  58.76 
 
 
666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  57.95 
 
 
675 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  58.82 
 
 
556 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  48.18 
 
 
650 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  55.29 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  47.62 
 
 
672 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  52.94 
 
 
539 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  28.21 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  25 
 
 
803 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  27.56 
 
 
443 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3420  Ribulose-bisphosphate carboxylase  26.51 
 
 
114 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.701353  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2783  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  31.76 
 
 
139 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0685  ribulose-bisphosphate carboxylase  27.06 
 
 
144 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>