More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0930 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  98.92 
 
 
186 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  75.27 
 
 
186 aa  291  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  74.73 
 
 
186 aa  291  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  75.27 
 
 
186 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  74.73 
 
 
186 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  74.73 
 
 
186 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  74.73 
 
 
186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  74.73 
 
 
186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  73.66 
 
 
186 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  72.04 
 
 
186 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  70.43 
 
 
186 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  69.89 
 
 
186 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  65.05 
 
 
186 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  67.2 
 
 
186 aa  255  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  66.67 
 
 
186 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  61.58 
 
 
177 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  38.1 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  35.1 
 
 
204 aa  123  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  34.47 
 
 
273 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 
675 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  38.89 
 
 
552 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  37.99 
 
 
672 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  38.76 
 
 
556 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  38.33 
 
 
666 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  38.33 
 
 
666 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  36.88 
 
 
650 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  31.31 
 
 
248 aa  98.6  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  30.24 
 
 
205 aa  91.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.04 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  32.14 
 
 
539 aa  87.8  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  37.23 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.5 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  38.66 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.92 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  42.24 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  40.3 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  30.18 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  38.28 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  38.28 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  38.28 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  42.61 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  42.24 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  42.24 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  42.24 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  41.88 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.24 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  41.88 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  41.88 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  29.55 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  33.14 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  38.33 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  38.66 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  38.02 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  38.02 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  33.14 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  32.54 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  32.54 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  38.02 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  38.02 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  33.14 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  38.81 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  40.16 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  38.71 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  31.95 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.5 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  34.09 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  40.44 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  31.95 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  29.65 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  34.62 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  29.65 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  31.07 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  35.56 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  34.84 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  33.95 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  33.95 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  35.09 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  35.56 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  41.13 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  36.64 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  35.56 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  33.93 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  36.64 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  36.64 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  36 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  37.31 
 
 
172 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  36.43 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  35.88 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  33.93 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.72 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  33.75 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  33.85 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  36.76 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  38.46 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  38.46 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.903191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>