More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  86.02 
 
 
186 aa  331  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  85.48 
 
 
186 aa  328  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  84.95 
 
 
186 aa  320  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  83.87 
 
 
186 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  82.8 
 
 
186 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  66.67 
 
 
186 aa  263  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  69.35 
 
 
186 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  69.35 
 
 
186 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  69.35 
 
 
186 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  67.2 
 
 
186 aa  255  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  66.13 
 
 
186 aa  255  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  67.74 
 
 
186 aa  254  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  68.82 
 
 
186 aa  254  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  69.89 
 
 
186 aa  254  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  67.74 
 
 
186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  63.28 
 
 
177 aa  228  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  37.62 
 
 
204 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  37.57 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  35.75 
 
 
273 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  36.96 
 
 
666 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  36.96 
 
 
666 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  34.78 
 
 
675 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  34.24 
 
 
552 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  35.87 
 
 
672 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  35.59 
 
 
556 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  37.58 
 
 
650 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  32.65 
 
 
248 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  34.2 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  33.33 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  32.74 
 
 
539 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  36.57 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  39.39 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.03 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  38.35 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  38.06 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  37.69 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  34.56 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  41.41 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  36.92 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  36.15 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  37.78 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  35.53 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  34.56 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  38.46 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  32.08 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  32.08 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  31.52 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  32.08 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  33.09 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  39.26 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  35.16 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  34.51 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  38.1 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  34.21 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  32.26 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  32.35 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  38.33 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  34.59 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  33.09 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  35.11 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  30.39 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  33.1 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  35.71 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  32.35 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  32.35 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  35.38 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  33.1 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  30.64 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  28.02 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  32.93 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  31.62 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  37.3 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  33.8 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  36.09 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  36.64 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  30.91 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  33.88 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  31.69 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  33.58 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  37.6 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.59 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  35.66 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  32.09 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  36.57 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  32.34 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  38.06 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.76 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>