More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3020 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  53.27 
 
 
205 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  41.33 
 
 
672 aa  159  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  39.2 
 
 
666 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  39.2 
 
 
666 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 
675 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  37.76 
 
 
556 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  36.55 
 
 
552 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  38 
 
 
183 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  38.6 
 
 
539 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  34.12 
 
 
650 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  34.52 
 
 
186 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  34.01 
 
 
186 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  32.03 
 
 
273 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  33.5 
 
 
186 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  32.32 
 
 
186 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  33.5 
 
 
186 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  32.99 
 
 
186 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  31.31 
 
 
186 aa  98.6  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  31.31 
 
 
186 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  31.98 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  32.83 
 
 
186 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  32.81 
 
 
177 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  32.65 
 
 
186 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  30.81 
 
 
186 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  30.81 
 
 
186 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  30.81 
 
 
186 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  32.49 
 
 
186 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  32.65 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.21 
 
 
175 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  36.21 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  35.37 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  32.98 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  33.52 
 
 
174 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  32.39 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  34.08 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  39.86 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  32.96 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  30.89 
 
 
181 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  35.79 
 
 
172 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  33.56 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  32.76 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  30.49 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  30.46 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  38.41 
 
 
174 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  30.73 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  39.34 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  32.12 
 
 
174 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  32.93 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  33.72 
 
 
171 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  33.56 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  30.54 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  28.04 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  27.37 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  30.57 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  31.17 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  31.17 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  31.17 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  31.97 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  30.73 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  32.89 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  27.51 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  32.45 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  37.41 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  27.93 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  31.93 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  35.57 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  31.93 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  32.21 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  34.48 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1253  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  30.96 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  32.67 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.93 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.47 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  31.93 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  31.93 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  31.93 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  30.2 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  31.09 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.07 
 
 
174 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  40 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  34.46 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  31.93 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  31.79 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  31.03 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  28.65 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  33.62 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  31.17 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  36.62 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  30.16 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  37.9 
 
 
177 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  27.89 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  32.9 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  34.17 
 
 
180 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  28.34 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  34.51 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.45 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  28.19 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  28.19 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>