More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5198 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5198  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1632  hypothetical protein  63.95 
 
 
172 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.096808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1316  hypothetical protein  66.86 
 
 
187 aa  204  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1075  hypothetical protein  54.12 
 
 
172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3205  hypothetical protein  52.6 
 
 
174 aa  174  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5983  transferase family protein  55.49 
 
 
172 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  42.53 
 
 
174 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  39.31 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  42.54 
 
 
183 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  39.77 
 
 
175 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  42.77 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  42.29 
 
 
176 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  42.77 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  42.29 
 
 
176 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  42.69 
 
 
172 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 
174 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 
174 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  39.2 
 
 
176 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  37.57 
 
 
173 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  40.8 
 
 
175 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3912  hypothetical protein  41.71 
 
 
176 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  42.2 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  39.05 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  42.44 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  41.67 
 
 
232 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  40 
 
 
184 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  41.67 
 
 
183 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  44 
 
 
176 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 
177 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 
174 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  44.24 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  41.42 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  41.71 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  41.28 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.82 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  40.8 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  39.52 
 
 
174 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  38.92 
 
 
174 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  37.72 
 
 
174 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  43.97 
 
 
234 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  37.93 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.93 
 
 
175 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  40.23 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  40.59 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  38.69 
 
 
175 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  37.93 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  37.85 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  36.63 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  40.94 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  40.94 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  39.87 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  39.31 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  40.61 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  31.4 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.53 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  45.16 
 
 
173 aa  125  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  38.01 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  45.81 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  38.01 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  39.08 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  43.48 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.57 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  35.93 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 
194 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  38.15 
 
 
174 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  38.92 
 
 
174 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  39.77 
 
 
175 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  42.86 
 
 
175 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  37.72 
 
 
174 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  39.29 
 
 
179 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  37.57 
 
 
174 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  38.18 
 
 
170 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  38.55 
 
 
172 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  39.53 
 
 
181 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 
261 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  34.68 
 
 
174 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  36.84 
 
 
174 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  38.15 
 
 
174 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  39.29 
 
 
177 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  36.99 
 
 
174 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  42.24 
 
 
175 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5226  hypothetical protein  38.86 
 
 
176 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  38.46 
 
 
177 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  37.93 
 
 
177 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 
174 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  41.72 
 
 
182 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 
174 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  36.09 
 
 
175 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  37.13 
 
 
174 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  35.63 
 
 
184 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.69 
 
 
174 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  37.95 
 
 
173 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  37.87 
 
 
177 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  35.76 
 
 
170 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  36.21 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  34.68 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>