More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5983 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5983  transferase family protein  100 
 
 
172 aa  342  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3205  hypothetical protein  66.47 
 
 
174 aa  218  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1632  hypothetical protein  62.43 
 
 
172 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.096808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5198  hypothetical protein  55.49 
 
 
178 aa  184  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1075  hypothetical protein  53.18 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1316  hypothetical protein  54.8 
 
 
187 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  48 
 
 
234 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  44 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 
173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  37.43 
 
 
183 aa  127  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  41.18 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  45 
 
 
172 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  44.81 
 
 
232 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  41.25 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  42.61 
 
 
174 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  44.25 
 
 
175 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  41.67 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  36.14 
 
 
173 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  41.36 
 
 
170 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  41.18 
 
 
174 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  43.82 
 
 
176 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  41.14 
 
 
174 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  40.36 
 
 
175 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  37.95 
 
 
175 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  48.09 
 
 
182 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  43.48 
 
 
175 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  39.2 
 
 
175 aa  120  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  42.11 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  42.86 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  42.86 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  38.82 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  40.34 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  39.64 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  39.2 
 
 
174 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  43.03 
 
 
172 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  44.37 
 
 
176 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  45.33 
 
 
163 aa  117  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  38.46 
 
 
187 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  41.76 
 
 
174 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  37.87 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  47.69 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  38.55 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  43.1 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.1 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  40.48 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  44.37 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  39.75 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  39.75 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  39.26 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  41.07 
 
 
183 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  45.71 
 
 
174 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  38.56 
 
 
173 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 
174 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  48.48 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  39.75 
 
 
182 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  41.67 
 
 
174 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  45.32 
 
 
170 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  45.32 
 
 
170 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  45.32 
 
 
170 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  42.24 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  39.13 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  38.07 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  40.59 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  45.71 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  36.9 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  38.51 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1961  ferripyochelin binding protein  45.39 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.57 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  46.1 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  45 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  43.57 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  44.29 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  45 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 
174 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  40.12 
 
 
172 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  37.58 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  40.37 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  44.29 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  43.18 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  37.72 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  45 
 
 
174 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1347  ferripyochelin binding protein  32.52 
 
 
169 aa  111  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  41.78 
 
 
180 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  45 
 
 
174 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 
175 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  46.21 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  42.74 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  38.64 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  36.31 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  43.88 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  41.43 
 
 
184 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.86 
 
 
181 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  42.96 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.58 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  45.45 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  42.96 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  41.21 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>