More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4404 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 331 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  67.29 
 
 		 349 aa  427  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.14 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  63.12 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  62.39 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.9 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  61.42 
 
 		 356 aa  362  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  63.19 
 
 		 344 aa  361  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  60.98 
 
 		 338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  57.14 
 
 		 351 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  58.48 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.36 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  59.63 
 
 		 338 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.37 
 
 		 322 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.46 
 
 		 337 aa  311  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.85 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  52.12 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  52.12 
 
 		 342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  52.65 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  51.52 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.69 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  50.45 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  50.91 
 
 		 335 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  51.2 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.94 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.62 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  49.53 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  50.15 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.8 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  53.11 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.51 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  51.96 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.54 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  50.46 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  49.69 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  42.77 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  38.02 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.94 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.78 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.82 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.42 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.56 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.62 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.01 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.45 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.26 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  37.07 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.34 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.94 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.81 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.95 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.85 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  40.55 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.16 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.58 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  34.35 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.4 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.72 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.58 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.6 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.35 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  35.26 
 
 		 323 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.35 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.95 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.82 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.94 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.95 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.23 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  34.63 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  33.86 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  35.05 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.72 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  31.48 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>