More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0231 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  43.91 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  44.54 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  40.36 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 297 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  37.89 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 282 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 282 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  32.42 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  31.6 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  37.21 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  36.1 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  30.14 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  30.6 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 		 130 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  43.94 
 
 		 126 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 119 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 131 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 146 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.97 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0132  MerR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 160 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 129 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.66 
 
 		 135 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 141 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 141 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 151 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 157 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 166 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  47.06 
 
 		 146 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 146 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>