70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0328 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  100 
 
 		 394 aa  814    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  41.16 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  38.99 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  36.8 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  34.38 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  34.99 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  31.12 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  28.54 
 
 		 441 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  28.68 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  26.07 
 
 		 421 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  28.18 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  27.93 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  27.93 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  27.46 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  25 
 
 		 412 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  23.08 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  29.13 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  29.13 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  21.11 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  24.9 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  32.46 
 
 		 186 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  34.19 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  25.93 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  32.76 
 
 		 147 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  23.77 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  29.85 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  25.88 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  30.67 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  30 
 
 		 412 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1085  integrase family protein  35.71 
 
 		 96 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  30.15 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.05 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  30.15 
 
 		 312 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.74 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  27.97 
 
 		 370 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  22.08 
 
 		 309 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  21.59 
 
 		 300 aa  46.2  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  28.99 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4563  integrase domain protein SAM domain protein  22.82 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  23 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.9 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  28 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  28 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  28 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0278  hypothetical protein  29.76 
 
 		 141 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  22.88 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  21.68 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  21.21 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  21.21 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  21.21 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  22.54 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  22.54 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  24.63 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>