16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4987 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  100 
 
 		 372 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  67.48 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  63.14 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  63.14 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  25.34 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  25.68 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  27.62 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  24.9 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  26.83 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  26.19 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  24.43 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  22.99 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  24.03 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  24.37 
 
 		 506 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>