18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01693 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  840    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  840    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  63.14 
 
 		 372 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  59.85 
 
 		 405 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  28.06 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  25.61 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  29.36 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  25.08 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  28.43 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  25.94 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  27.75 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  27.19 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  23.77 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  29.46 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  23.25 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  24.42 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>