40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3234 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  100 
 
 		 399 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  31.13 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  28.68 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  27.68 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  26.95 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  27.61 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  29.3 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  28.4 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  29.82 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  25 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  25 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  25 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  26.81 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  23.08 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1085  integrase family protein  44.44 
 
 		 96 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  28.95 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  22.38 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  27.35 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  27.35 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  23.39 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  23.39 
 
 		 312 aa  49.7  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.98 
 
 		 305 aa  49.7  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  30.77 
 
 		 147 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.38 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 322 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  28.5 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  25.57 
 
 		 324 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  28.57 
 
 		 361 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 324 aa  46.6  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  27.59 
 
 		 186 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  29.1 
 
 		 191 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0278  hypothetical protein  28.18 
 
 		 141 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  28.99 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>