58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2289 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  100 
 
 		 412 aa  845    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  29.73 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  28.68 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  27.58 
 
 		 396 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  28.4 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  24.63 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  25 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  32.04 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  25.9 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  24.7 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  29.49 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  31.96 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 283 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  22.73 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  22.73 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  22.53 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  26.83 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  28.26 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.54 
 
 		 285 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  31.9 
 
 		 186 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  30.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  28.37 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  28.37 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  29.17 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  30.83 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  27.44 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.14 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.47 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  28.03 
 
 		 306 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  23.56 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  23.36 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  27.7 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  30.14 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  25.55 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.27 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.49 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  28.29 
 
 		 268 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.11 
 
 		 304 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  29.77 
 
 		 391 aa  43.1  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  33.68 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>