40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2951 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  100 
 
 		 407 aa  826    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  34.31 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  35.45 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  31.12 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  34.4 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  29.22 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  25.13 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  29.3 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  24.67 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  28.16 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  27.74 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  27.74 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  24.7 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  22.92 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  21.67 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  36.7 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  24.31 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  27.3 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  27.93 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  34.27 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  26.19 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  28.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  25.98 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  26.38 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  33.67 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  24.85 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  24.88 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  24.88 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>