29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0582 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  916    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  916    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  916    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  27.93 
 
 		 394 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  27.74 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  25.97 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  25.66 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  24.86 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  34.71 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  24.52 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  25 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  22.43 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  22.48 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  23.21 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  36.45 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  22.73 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  25.97 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  29.41 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  34.45 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  28.85 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.39 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  32.65 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  30.3 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  26.21 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>