23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0311 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  100 
 
 		 408 aa  842    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  25.7 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  26.15 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  28.46 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  26.19 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  27.94 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  23.08 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  31.96 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  24.53 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  25.79 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  25.21 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  25.97 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  25.97 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  24.92 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  24.03 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.75 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  26.56 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  33.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>