40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02977 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  100 
 
 		 147 aa  308  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  68.97 
 
 		 440 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  48.21 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  48.42 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  33.33 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 400 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  34.31 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06220  hypothetical protein  93.33 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06206  hypothetical protein  90.32 
 
 		 39 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  28.18 
 
 		 428 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  32.76 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  32.14 
 
 		 441 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  30.08 
 
 		 412 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  42.86 
 
 		 385 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  30.77 
 
 		 399 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  26.56 
 
 		 408 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  33.67 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  44.9 
 
 		 299 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  36.07 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  46.34 
 
 		 357 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0116  site-specific recombinase XerD-like  31.34 
 
 		 127 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  48.78 
 
 		 358 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 304 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  37.78 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  35.56 
 
 		 519 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  35.56 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  28.99 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  40.43 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  35.56 
 
 		 364 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  35.56 
 
 		 364 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  35.56 
 
 		 344 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  35.56 
 
 		 395 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>