35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4063 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  100 
 
 		 441 aa  909    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  31.7 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  28.54 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  27.68 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  26.21 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  22.74 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  25.84 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  28.4 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  28.16 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  25.9 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  25.23 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  28.46 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  23.21 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  23.21 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1085  integrase family protein  33.73 
 
 		 96 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  24.43 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  22.03 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  32.14 
 
 		 147 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  29.7 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  23.12 
 
 		 384 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  29.32 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.33 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  23.77 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  23.77 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  20.26 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 		 295 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  27.31 
 
 		 400 aa  43.5  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>