19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5184 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  100 
 
 		 405 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  67.48 
 
 		 372 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  59.85 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  59.85 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  28.74 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  29.2 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  25.93 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  28.64 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  25.68 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  23.51 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  29.13 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  30.34 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  26.17 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  24.26 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  24.54 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  23.83 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.78 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>