More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3204 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3204  general substrate transporter  100 
 
 		 429 aa  841    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  44.41 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.34 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  45.32 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.95 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.95 
 
 		 437 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  43.21 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  45.04 
 
 		 439 aa  278  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  42.57 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  42.37 
 
 		 427 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.12 
 
 		 482 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  44 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.55 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.74 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 434 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.49 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.87 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 442 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  41.84 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  43.8 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  41.84 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  44.09 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  44.09 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  44.09 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.48 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  44.09 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.48 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.48 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.6 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  38.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  40.93 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  41.31 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  38.84 
 
 		 438 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  38.53 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  40.69 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  40.69 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  40.69 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  40.69 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 431 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  40.69 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  40.69 
 
 		 443 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  40.4 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.73 
 
 		 447 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.93 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>