More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2805 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  70.79 
 
 		 477 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  80.88 
 
 		 455 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  70.36 
 
 		 481 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 455 aa  932    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  65.73 
 
 		 475 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 		 500 aa  589  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 490 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 472 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 491 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 492 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 468 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 484 aa  343  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 477 aa  342  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 470 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 512 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 480 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.46 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 493 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 490 aa  329  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 465 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 498 aa  323  5e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 473 aa  323  6e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 480 aa  322  6e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 466 aa  322  7e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3604  glutamyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 495 aa  320  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 503 aa  319  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 495 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 476 aa  316  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 490 aa  316  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 470 aa  316  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 469 aa  316  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 471 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>