46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1421 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  60.69 
 
 
263 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  50.96 
 
 
270 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  37.74 
 
 
264 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  40.53 
 
 
268 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  38.26 
 
 
266 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  35.21 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  34.57 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  32.67 
 
 
270 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  33.83 
 
 
271 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  28.52 
 
 
264 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  30.88 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  30.88 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  30.88 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  30.56 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  30.08 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  30.11 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  31.05 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  44.9 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  28.21 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  29.7 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.19 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  27.87 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  27 
 
 
280 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  26.64 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  27.2 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  26.84 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  24.9 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  24.19 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  26.17 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  25.77 
 
 
276 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  26 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  32.04 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  25.83 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00335  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78618]  22.02 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.628153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  25.82 
 
 
386 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  25.9 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  25.9 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  23.16 
 
 
270 aa  45.4  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  22.79 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  25.21 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  28.22 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  24.79 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>