More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0294 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 413 aa  807    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  58.93 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  53.44 
 
 		 411 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  53.83 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  54.45 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  38.9 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  39.48 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.87 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 386 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  36.26 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 440 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.44 
 
 		 452 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.33 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 		 438 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 397 aa  99.8  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 438 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 672 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  35.74 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 398 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 426 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0847  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  34.86 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  35.12 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  32.79 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  31.99 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 498 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 		 443 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 		 443 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  37.29 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.19 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  37.04 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  36.1 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 495 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>