More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0291 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 382 aa  771    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  51.85 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  50.27 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  48.27 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  47.18 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  50.4 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  49.07 
 
 		 388 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  52.77 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  42.39 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.86 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 385 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  28 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 		 413 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  26.49 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0942  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.35 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 739 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.76 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  33.96 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.08 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  21.09 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  31.95 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.79 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 750 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 385 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 871 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>