More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1178 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  58.49 
 
 		 221 aa  270  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  59.36 
 
 		 224 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.55 
 
 		 211 aa  266  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 210 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.55 
 
 		 211 aa  266  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  58.02 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 211 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 210 aa  264  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  59.09 
 
 		 226 aa  264  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 218 aa  264  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  62.74 
 
 		 218 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  57.99 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  58.8 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  57.99 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  57.08 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  56.95 
 
 		 222 aa  260  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  60.85 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  55.61 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  55.76 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  55.76 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  53.12 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  55.45 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  58.29 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  54.81 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  52.47 
 
 		 286 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3311  30S ribosomal protein S3  54.09 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000058787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3291  30S ribosomal protein S3  54.09 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000159884  hitchhiker  0.00000252184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  52.51 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3013  30S ribosomal protein S3  53.57 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000335081  decreased coverage  0.002387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  53.57 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  56.07 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  56.07 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  56.5 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  54.81 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  54.75 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  54.75 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3173  30S ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000329373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  54.75 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  53.36 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  52.53 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 219 aa  247  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 221 aa  247  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 228 aa  247  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  54.75 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 229 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  54.84 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2626  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0741143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  56.16 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3770  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000624926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  53.67 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3062  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000122398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3484  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3740  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3798  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1930  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000560778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3163  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0285  ribosomal protein S3  52.49 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 213 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  52.89 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>