More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2753 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  100 
 
 		 308 aa  630  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  51.71 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  49.5 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  50 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  51.37 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  51.03 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  51.03 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  50.68 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  50.68 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  48.64 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  49.66 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  50 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  47.19 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  47.19 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  48.11 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  50.33 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  50.33 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  48.28 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  47.33 
 
 		 311 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  50 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  50 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  50 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  50 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  50 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  46.53 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  45.78 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  45.78 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  41.64 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.67 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  32.89 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.11 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.51 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.07 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.33 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  31.13 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  32.37 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.27 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.66 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.02 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.28 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  33.02 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  33.02 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  32.77 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  32.08 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.67 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.44 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.89 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.07 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.47 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.39 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  33.82 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  28.85 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.39 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.23 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  31.02 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.54 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  33.45 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  31.72 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.1 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.96 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.33 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.41 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  32.67 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.36 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  31.15 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.16 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.92 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.09 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  33.6 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.71 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  28.8 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  29.51 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>