265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1728 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  62.42 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  60.51 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  59.24 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.36 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.36 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.36 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.36 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.36 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  48.92 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  45.7 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  47.01 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.85 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  47.18 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  45.7 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  46.72 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  44.16 
 
 		 259 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  41.3 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.38 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 337 aa  111  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  46.76 
 
 		 209 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  45.74 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.6 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  42.38 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  44.93 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.6 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.77 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  44.08 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.88 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  45.39 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.1 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  38.18 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  43.28 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  46.04 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.01 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  41.26 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  43.57 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  44.06 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  43.8 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  43.06 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.8 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  41.3 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  37.95 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  44.6 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  44.6 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2332  dihydrofolate reductase  36.94 
 
 		 193 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.3 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>