More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1689 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  100 
 
 		 242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  50.22 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  51.54 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  53.73 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  54.67 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  54.55 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.47 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  54.63 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  54.73 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  54.73 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  54.73 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.68 
 
 		 236 aa  198  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  50.44 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  54.09 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  50.65 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  54.37 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  53.23 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  50.45 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  50.68 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  51.49 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  52.13 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.96 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  52.63 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  50.69 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  51.49 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  50.23 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  51.94 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  52.68 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  49.11 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  51.67 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  54.59 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  53.95 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  55.94 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.99 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  51.92 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  53.62 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  52.66 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  50.49 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  47.6 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.75 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  53.62 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.49 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  54.68 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  50.45 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.5 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.5 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  54.68 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  52.43 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  49.77 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  53.02 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  46.43 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  45.75 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  55.12 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  52.83 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  53.62 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  53.46 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>